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血清和血浆样本溶于QIAzol Lysis Reagent中。加入氯仿后,裂解液离心后分成水相和有机相。RNA位于上层水相,DNA位于中间相,蛋白位于下层有机相或中间相。提取上层水相后,加入乙醇以提供RNA结合的合适条件,RNA分子大于18个核苷酸。样品再加入RNeasy MinElute离心柱,总RNA结合到膜上,苯酚和其他污染物被有效洗去,用12ul无RNase水中洗脱出高纯度高浓度的RNA。
关于血清血浆样本
1,血清和血浆样本中主要含有小RNAs(<100nt),因此无需分开纯化小RNA和大RNA组分。
2,50-200µl人血浆和血清中RNA的产量通常太低,大概在50-150ng, 无法用NanoDrop等分光光度法OD测量进行量化。可以使用更灵敏的比色或荧光测定法进行定量,即RiboGreen测定法。
3,不能有细胞或细胞碎片的污染。当RNA产量偏高或通过变性琼脂糖凝胶电泳和溴化乙锭染色或使用QIAxcel®系统或Agilent 2100生物分析仪,出现rRNA条带,说明有细胞或细胞碎片的污染。
由于血浆和血清中RNA的含量极地,miRNA定量推荐使用qiagen的LNA修饰的miRCURY LNA miRNA PCR Starter Kit(cat:339320),引物LNA修饰且验证有效、灵敏度高(1pgRNA可检测)、特异性好(单碱基区分)。