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线粒体制备的难点在于如何有效的获得无胞浆组分污染的线粒体。传统的制备方法费时费力且需要超速离心机。Qproteome Mitochondria Isolation Kit只需普通离心机就能快速，高重复性的制备高纯度线粒体，且保持线粒体的天然结构和完整的生物学活性，尤其适合细胞凋亡研究，双向凝胶电泳分析及其他生物化学分析。
与文献中的差速离心方法相比，细胞室标记蛋白分析表明Qproteome Mitochondria Isolation Kit获得的线粒体能最大程度避免交叉污染，胞浆污染物几乎没有，很大程度上方便了对低丰度蛋白物种的分析。2D-PAGE分析显示，温和的操作步骤可确保线粒体结构完整，其完整性可通过荧光染色进行验证。
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