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基因转录本选择

1.进入NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)官网主页,选“gene”输入:“基因名+物种[人human小鼠mouse大鼠rat]"点Search,弹出如下界面,核对基因 ID、名字、物种等信息,确认无误。点“RefSeq transcripts”查看该基因所有转录本及信息。

image.png

2.如何确定哪个转录本是该基因的代表?

2.1,根据RefSeq方案,一般在该基因所有转录本列表中排第一的是代表性转录本;

2.2,根据MANE方案,在uniprot数据库(https://www.uniprot.org/)中检索:基因名+物种,(也可以根据抗体公司官网上的抗原信息,点击“UniProt ID”)在该蛋白的页面中查看"MANE-Select",看到对应的转录本就是代表性转录本(如下图)。

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